生物工程學部成立於2021年10月，由齊魯工業大學生物工程學院、山東省科學院生物研究所兩個部門組建而成。齊魯工業大學生物工程學院始於1948年建校初期設立的釀造工藝專業，1978年設立工業發酵本科專業並於當年開始招生，1984年該專業更名為發酵工程專業，該專業是學校最早建立的專業之一，為學校重點學科。目前生物工程學部擁有國家一流本科專業1個，山東省一流本科專業1個，通過工程教育認證專業1個，設有五個本科專業：生物工程、生物技術、釀酒工程、釀酒工程（中新合作）和葡萄與葡萄酒工程專業，生物工程學部在發酵工程、生物與醫藥、生物學等專業可招收碩士研究生。

教師隊伍

　　學部共有教職工174人，其中教授、研究員等正高級專家28人，博士116人，擁有外聘院士1人，泰山學者特聘專家1人，泰山學者青年專家1人，泰山產業領軍人才2人，教育部新世紀優秀人才1人，國務院特貼專家1人，山東省有突出貢獻的中青年專家2人。

科研教學平台

　　學部目前擁有“生物基材料與綠色造紙國家重點實驗室”“中國輕工業微生物發酵工程重點實驗室” “山東省食品發酵工程行業技術中心”“山東省輕工生物基產品清潔生產與煉製協同創新中心”“山東省生物製造重點實驗室”“山東省生物工程實驗教學示範中心”“中德啤酒技術中心”“生物工程訓練中心”以及多家校企合作實驗室等技術平台，可以為教學、科研、社會服務工作提供保障。

人才培養

　　學院重視學生創新能力的培養與提高，積極組織學生參加大學生創新創業大賽，近2年，在第七屆中國國際互聯網+大學生創新創業大賽中生物工程學院獲得國家級金獎1項，國家級銅獎3項，國際賽道國家級銅獎1項，在第十七屆“挑戰杯”全國大學生課外學術科技作品競賽（“大挑”）“揭榜掛帥”專項賽獲得國家級特等獎1項。在山東省大學生科技創新大賽中獲得一等獎、二等獎、三等獎各1項，第十七屆挑戰杯山東省大學生課外學術科技作品競賽獲得省賽特等獎1項，省賽三等獎1項。2021年互聯網+省賽中，生物工程學院獲得省賽金獎項目5項，銀獎項目2項，銅獎項目4項。近三年，本科畢業生綜合就業率達98%以上，beplay中心錢包體育錢包升學率達到30%。研究生發表學術論文300餘篇，其中SCI、EI收錄150餘篇，大約20%研究生考取國內重點大學的博士研究生，繼續深造。